MiLaboratories, Biyoinformatik ve Genomik Araştırmalar İçin Devrim Yaratan Yeni Platformunu Tanıttı

DNA dizileme alanındaki ilerlemeler ve yeni nesil dizileme (NGS) teknolojisinin ürettiği devasa genomik veri miktarı, biyologların bu büyük verileri daha kolay analiz etmelerini sağlayacak yazılımlar geliştirmek için bir girişim fırsatı yaratmıştır. Bu yazılım, yeni aşıların, kanser tedavilerinin ve benzeri yeniliklerin geliştirilmesine katkıda bulunabilir.

Son dört yıldır, San Francisco merkezli ve İspanya’nın Bilbao kentinde bir Ar-Ge tesisi bulunan MiLaboratories, biyologların verilerini işlemelerini, analiz etmelerini ve bir araya getirmelerini kolaylaştırmak için bir hesaplamalı biyoloji platformu geliştiriyor. Bu platform, veri görselleştirme ve generatif yapay zeka gibi özellikleri içererek kullanım kolaylığını artırmayı hedefliyor.

Platform, ayrıca diğer bilim insanları için bir pazar yeri olarak tasarlanmış olup, daha spesifik hesaplama araçlarını uygulama formunda dağıtmalarına olanak tanıyor. MiLaboratories, biyoloji, bilgisayar bilimi ve matematik alanlarında uzmanlaşmış bilim insanlarını — yani biyoenformatikçileri — hedef alıyor.

MiLaboratories CEO'su Stan Poslavsky “Bu, biyologlar için 'kodsuz' bir yaklaşım ve ayrıca biyoenformatikçilerin gerçek uygulamalar geliştirebilmeleri için bir [açık kaynak] SDK — yazılım geliştirme kiti — sunuyoruz. Benim ve kurucularımızın bilimsel kariyeri boyunca, modern tedavilerin ve ilaçların nasıl geliştirildiğinde büyük bir verimsizlik olduğunu gördük. Bu verimsizlik, biyologlar tarafından üretilen büyük veriler ile bu verilerin analiz edilmesi arasındaki sürtüşmeden kaynaklanıyor.” demiştir.

 NGS verilerinin analizi için "binlerce" yazılım programı ve araç mevcut olsa da, Poslavsky çoğunun akademi içinde geliştirilmiş olduğunu ve bu nedenle odak noktasının genellikle kullanılabilirlikten ziyade işlevsellik olduğunu belirtiyor.

Biyologların, birden fazla analiz sonucunu bir araya getirmeye ve entegre etmeye ihtiyaç duyduğunu belirtiyor. "Birleşik bir bakış açısıyla, ne olduğunu anlamanızı sağlıyor. Ve işte bu noktada platformumuz büyük ölçüde yardımcı oluyor," diye ekliyor.

Girişim, biyoenformatikçilerin genomik veri işleme gibi rutin işlerle uğraşmak yerine daha karmaşık algoritmalar geliştirmeye odaklanabilmelerini sağlamayı hedefliyor.

"Biyoenformatikçiler aslında çok fazla zaman harcayarak biyologlar için yazılımları çalıştırma işini yapıyor," diyor Poslavsky. "Bu verileri işlemek için Linux makineleri kullanmanız, SSH üzerinden bağlantı kurmanız, karmaşık yazılım araçlarını çalıştırmanız gerekiyor ki bu da veri analizini ve içgörü elde etmeyi sağlıyor."

"Bir doktorun Linux üzerinde veya HPC [yüksek performanslı bilgi işlem] kümesinde bu işleri yapacak becerisi yok çünkü başka sorumlulukları var. Ve aslında birçok biyoenformatikçi, şirketlerde ve akademide bu rutin işleri yapmakla meşgul" diye ekliyor..

Perşembe günü, MiLaboratories resmi olarak SDK'sı Platforma.bio'yu tanıttı. Bu SDK, üçüncü taraf geliştiricilerin uygulama oluşturmasına olanak tanıyor ve birkaç yıldır alfa ve beta testlerinde kullanılıyordu. Poslavsky, "yaklaşık 300 laboratuvar"ın betayı kullandığını ve şu ana kadar platformda "yaklaşık 20" uygulamanın bulunduğunu belirtiyor.

"Platformda mevcut olan ilk uygulamalar, biyolojik ve biyoenformatik uygulamalarımız etrafında inşa edilmiştir ve bu uygulamalar immünoterapi geliştirmeleriyle ilgilenen şirketler ve bireyler arasında oldukça popülerdir," diye açıklıyor.

2018 yılında kurulan girişim, geliştirme çalışmalarını sürdürmek ve topluluk inşasına yatırım yapmak amacıyla 10 milyon dolarlık bir Seri A yatırım turunu duyurdu.  Poslavsky "Yatırım toplamanın temel nedeni, platformumuzun geliştirilmesine daha fazla insan kaynağı katmaktır. Daha fazla mühendis işe alıyoruz ve akademik topluluğu hedef alarak teknolojiyi yaymakla görevli geliştirici savunucularını işe alıyoruz," diyor.

Madrid merkezli Kfund'un liderliğinde gerçekleşen Seri A yatırım turuna Acrobator Ventures, EGB Capital, Courtyard Ventures, Somersault Ventures, Speedinvest ve Ten13 gibi yatırımcılar da katıldı.

MiLaboratories, yazılımını akademik kullanıcılara ücretsiz olarak sunarken, ticari kullanıcılar için ücretli bir modelden gelir elde ediyor. Poslavsky, şirketin şu anda yaklaşık 100 ödeme yapan müşteriye yaklaştığını belirtiyor.

"Büyük ilaç şirketlerinden birçoğu — Moderna, Bristol-Myers Squibb gibi — bizim müşterilerimiz," diyor ve ekliyor: "İyi bir gelirimiz var — bu da bizi yatırım fonlarına fazla bağımlı olmaktan kurtarıyor."

NGS tarafından üretilen devasa veri miktarının, işleme verimliliği açısından büyük bir zorluk oluşturduğunu vurgulayan Poslavsky, bu verilerin işlenmesinde maliyetlerin kontrol altında tutulması gerektiğini söylüyor.

MiLaboratories, rakiplerinden 10 kat daha fazla verimlilik sağlayan patentli bir teknoloji geliştirdiklerini belirtiyor. Bu teknolojinin, biyologlar için veri analizini büyük ölçüde basitleştirdiğini ancak işletme sahipleri için de önemli olduğunu vurguluyor.

Poslavsky, rakip olarak Seqera ve Nextflow yazılımını işaret ediyor ve açık kaynaklı NGS araçları gibi alternatiflerin mevcut olduğunu belirtiyor. Ancak MiLaboratories, araştırmacılara daha erişilebilir bir veri analiz yolu sunduğunu düşünüyor.

İlginizi çekebilir: Dave Clark’ın Yeni Tedarik Zinciri Girişimi Auger, 100 Milyon Dolar Yatırım Aldı

MiLaboratories, büyük veri analizini kolaylaştıran ve biyoenformatikçilere yönelik açık kaynak SDK sunan yeni platformuyla biyoteknoloji dünyasında fark yaratıyor.
 

MiLaboratories'nin geliştirdiği platform ve yaklaşımı, biyoinformatik dünyasında devrim niteliğinde bir yenilik sunuyor. DNA dizileme ve büyük veri analizinin karmaşıklığı, bu alanda çalışan biyologlar ve biyoenformatikçiler için yıllardır önemli bir zorluk oluşturmaktaydı. MiLaboratories'nin bu zorlukları ele alarak sunduğu çözümler, biyologların verileri daha verimli bir şekilde analiz etmelerine ve yorumlamalarına olanak tanıyarak modern bilimsel araştırmaların hızlanmasına katkıda bulunabilir.

MiLaboratories'nin en büyük avantajlarından biri, platformunun sadece teknik olarak yetenekli biyoenformatikçilere değil, aynı zamanda daha az teknik bilgiye sahip biyologlara da hitap etmesidir. "Kodsuz" bir yaklaşım benimseyen bu platform, kullanıcıların karmaşık veri analiz süreçlerine girmeden sonuçlara daha hızlı ulaşmalarını sağlıyor. Bu, biyologların daha çok bilimsel araştırmalarına odaklanmalarına olanak tanırken, biyoenformatikçilerin zamanlarını veri işleme yerine yeni algoritmalar ve modeller geliştirmeye ayırmalarını sağlıyor.

Ayrıca, açık kaynak SDK ile bilim insanlarına sağlanan uygulama geliştirme imkanı, sadece MiLaboratories platformunu değil, genel anlamda biyoinformatik yazılım ekosistemini de zenginleştirebilir. Bu tür bir yapı, bilimsel topluluğun bir araya gelerek daha fazla işlevsellik ve veri analizi araçları geliştirmesini teşvik ediyor. Bu da platformun sadece bir yazılım aracı değil, aynı zamanda bir bilimsel iş birliği merkezi haline gelmesini sağlıyor.

MiLaboratories'nin rekabet açısından en büyük avantajlarından biri, geliştirdiği teknolojinin sağladığı işlem verimliliğidir. Petabaytlarca verinin hızlı ve etkili bir şekilde işlenmesini mümkün kılan bu platform, kullanıcılarına geleneksel yöntemlere kıyasla 10 kat daha fazla verimlilik sağlıyor. Bu tür bir optimizasyon, büyük veri analiziyle uğraşan büyük ilaç şirketleri için kritik bir fark yaratabilir.

Rakiplerden Seqera ve Nextflow gibi çözümler piyasada yaygın olarak kullanılsa da MiLaboratories'nin sunduğu kullanım kolaylığı ve yüksek performans, araştırmacılara ve endüstri profesyonellerine önemli bir alternatif sunuyor. Özellikle biyologların veriler üzerinde daha hızlı ve daha az teknik engelle analiz yapmalarını sağlayarak rekabet avantajını pekiştiriyor.

MiLaboratories'nin stratejisinde akademik topluluğa yönelik geliştirdiği açık kaynak SDK ve platformun topluluk tarafından benimsenmesini sağlama çabası büyük bir öneme sahip. Biyoenformatik yazılımının çoğunlukla akademide geliştirildiği göz önüne alındığında, bu platformun geniş çapta benimsenmesi ve kullanılması, bilimsel araştırmalarda büyük bir hızlanmaya neden olabilir.

Ek olarak, büyük ilaç şirketleri ve araştırma kuruluşları ile kurulan ilişkiler, MiLaboratories'nin finansal sürdürülebilirliği açısından da olumlu bir gösterge. Bu tür bir gelir modeli, şirketin yatırım fonlarına olan bağımlılığını azaltırken, platformun sürekli gelişimini ve güncellenmesini sağlayabilir.

MiLaboratories'nin sunduğu yenilikçi çözümler, biyoinformatik ve hesaplamalı biyoloji alanlarında büyük bir değişime işaret ediyor. Platformun sağladığı kullanım kolaylığı, verimlilik ve genişletilebilirlik, modern biyoteknoloji araştırmalarının hızlanmasına ve daha etkili sonuçlar elde edilmesine olanak tanıyor. Şirketin hem akademik topluluğa hem de endüstriyel müşterilere odaklanması, teknolojisinin yayılımını ve bilimsel araştırmalara olan katkısını daha da güçlendiriyor.

MiLaboratories'nin bu adımı, biyoinformatik dünyasında yeni bir çağ başlatabilir ve gelecekte daha fazla bilim insanının büyük veriyi anlamlı içgörülere dönüştürmesine yardımcı olabilir. Bu gelişmeler, yeni tedavi yöntemlerinin ve ilaçların daha hızlı geliştirilmesine olanak tanıyarak, hem akademik araştırmalar hem de endüstriyel uygulamalar için büyük bir potansiyel taşıyor.